W szkole funkcjonuje 9 klas specjalnych. Uczniowie w tych oddziałach realizują treści edukacyjne zgodnie z wymaganiami MEN z odpowiednimi dostosowaniami dla aktualnych możliwości każdego z uczniów.
W szkole istnieją klasy specjalne dla uczniów realizujących podstawę programową dla uczniów z normą intelektualną oraz dla uczniów z niepełnosprawnością intelektualną.
Ważnych celem w edukacji uczniów w klasach specjalnych jest przygotowanie ich do funkcjonowanie w życiu dorosłym w tym celu prowadzone są zajęcia praktyczne z zakresu Treningu Umiejętności Praktycznych.
Uczniowie uczestniczą w zajęciach rewalidacyjnych i dodatkowych prowadzonych przez różnych specjalistów, Każda klasa specjalna ma własny program dostosowany do wieku uczniów i ich aktualnych możliwości rozwojowych.
Wychowawcy i nauczyciele klas specjalnych organizują dla uczniów różnego rodzaju imprezy, wycieczki i warsztaty we współpracy z instytucjami kultury w Koninie.
Uczniowie uczestniczą w życiu szkoły, biorąc udział w akcjach organizowanych przez SU. Każda klasa w sposób aktywny jest członkiem szkolnej społeczności.